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耀杰不凡丨第二刊：“肛拭子”頻頻上熱門？伯杰醫(yī)療邀你一起知其所以然

近日，采集“肛拭子樣本”用于新冠篩查的新聞成為大家熱議的焦點(diǎn)，事件的起因是1月20日

2022-02-21


“耀杰不凡”致敬幕后抗疫英雄推文解讀活動(dòng)


第二刊：“肛拭子”頻頻上熱門？伯杰醫(yī)療邀你一起知其所以然


近日，采集“肛拭子樣本”用于新冠篩查的新聞成為大家熱議的焦點(diǎn)，事件的起因是1月20日，北京新冠防控新聞發(fā)布會(huì)介紹，其已對(duì)大興某新發(fā)病例所在學(xué)校全體學(xué)生、教職工等全部進(jìn)行鼻咽拭子、口咽拭子、肛拭子及血清檢測。

那么問題來了，此次北京大興為什么在篩查中增加了“肛拭子”檢測？其實(shí)，有關(guān)樣本類型檢出率這一議題，早先便有眾多學(xué)者對(duì)其進(jìn)行過討論。2020年8月公布的《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第八版)》中也明確表示，可以在糞便、尿液中可分離到新冠病毒。

今天，筆者就帶大家一同解析來自深圳市第三人民醫(yī)院的劉映霞教授、劉磊教授與來自中科院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院的李亮教授團(tuán)隊(duì)的對(duì)該議題產(chǎn)生的探討。深圳三院在疫情期間，第一時(shí)間“全員動(dòng)員、全域作戰(zhàn)”，在深圳抗疫的戰(zhàn)場中全力投入，更是首次在全國率先從確診患者糞便中檢測出新冠病毒核酸陽性。

本期研究主題：新冠肺炎患者腸道排毒特征規(guī)律及不同標(biāo)本病毒脫落情況研究

鼻咽拭子、口咽拭子、痰液、支氣管灌洗液及肛拭子這些不同類型的標(biāo)本與檢測結(jié)果之間到底存在著什么樣的聯(lián)系呢？不同的病程進(jìn)展情況下，上述各樣本類型是否存在檢出差異？且聽大咖見解，一一道來~

解讀文獻(xiàn)1：《The Time Sequences of Oral and Fecal Viral Shedding of Coronavirus Disease 2019(COVID-19) Patients》

本研究成果由深圳市第三人民醫(yī)院的劉映霞教授、劉磊教授和中科院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院的李亮教授團(tuán)隊(duì)在2020年5月16日發(fā)表于胃腸病學(xué)和肝病專業(yè)領(lǐng)域國際排名第一的醫(yī)學(xué)雜志《胃腸病學(xué)（Gastroenterology）》，研究主題為新冠肺炎患者的腸道排毒特征及規(guī)律。



本研究持續(xù)對(duì)深圳三院住院的401名實(shí)驗(yàn)室確診的COVID-19患者糞便及呼吸道樣本中的病毒核酸進(jìn)行監(jiān)測，跟蹤隨訪長達(dá)三個(gè)月以上， 研究發(fā)現(xiàn)此次SARS-CoV-2在感染早期（病程第1周）從腸道排出的陽性率最高（44.19%），而2003年的SARS病毒在腸道的檢出率通常需要在2~3周時(shí)才能達(dá)到高峰。隨著病程進(jìn)展，SARS-CoV-2在糞便中病毒核酸的陽性率逐步下降，在病程的4~5周形成一個(gè)平臺(tái)期。通過對(duì)患者的臨床資料分析，在病程的3~5周時(shí)，大部分患者臨床癥狀已消失，各項(xiàng)指標(biāo)達(dá)到了出院標(biāo)準(zhǔn)，但仍有12%的患者糞便可以持續(xù)排毒，提示對(duì)于康復(fù)期患者仍需加強(qiáng)糞便管理，防止糞口傳播。研究發(fā)現(xiàn)在病程第7周時(shí)仍然有2例患者糞便核酸陽性，但病程7周以上的患者（共篩檢303例）的糞便病毒核酸未再檢出陽性。（見圖1）



圖1. 患者糞便中 SARS-CoV-2在病程不同時(shí)間（周）的檢測情況。


研究同時(shí)還收集了糞便病毒核酸陽性的患者配對(duì)的呼吸道樣本，共517對(duì)（同一天采集的糞便和呼吸道樣本），結(jié)果發(fā)現(xiàn)29.8%(111對(duì))的患者糞便病毒RNA檢測呈陽性，而呼吸道樣本中呈陰性，這表明在呼吸道中病毒被清除后，病毒仍有可能在腸道中復(fù)制，仍有可能會(huì)發(fā)生糞口傳播的風(fēng)險(xiǎn)。當(dāng)兩類樣本同時(shí)陽性時(shí)，糞便樣本病毒載量普遍較呼吸道樣本高，提示對(duì)糞便樣本的病毒核酸檢測，有助于提高新冠病毒感染的陽性率。

研究還發(fā)現(xiàn)兒童新冠感染患者糞便的病毒陽性率遠(yuǎn)高于成人，提示要重視兒童新冠病毒感染患者糞便樣本的病毒核酸檢測和管理；同時(shí)發(fā)現(xiàn)胃腸道癥狀的存在似乎與糞便樣本病毒陽性無相關(guān)性，提示新冠病毒可能將腸道作為儲(chǔ)存和復(fù)制的場所，但尚未發(fā)現(xiàn)其對(duì)腸道功能的嚴(yán)重影響；此外，患者的中性粒細(xì)胞水平與病毒在糞便中持續(xù)時(shí)間呈正相關(guān)，而抗病毒治療啟動(dòng)時(shí)間與病毒在糞便中持續(xù)時(shí)間呈負(fù)相關(guān)，提示早期有效抗病毒治療也許能夠縮短SARS-CoV-2在腸道存在時(shí)間。


解讀文獻(xiàn)2：Laboratory Diagnosis and Monitoring the Viral Shedding of SARS-CoV-2 Infection


本文由深圳市第三人民醫(yī)院國家傳染病臨床研究中心的劉映霞教授團(tuán)隊(duì)通過RT-PCR檢測分析了不同呼吸道標(biāo)本，并對(duì)比了新冠患者上呼吸道和下呼吸道之間的病毒脫落情況的差異。研究對(duì)不同時(shí)期、不同樣本的病毒載量提供了翔實(shí)的研究數(shù)據(jù)，從而提高了新冠檢測的準(zhǔn)確性。


樣本情況：


本期研究收集了410例患者的3,552份呼吸道標(biāo)本，包括559份口咽拭子，2,231份鼻咽拭子，696份痰標(biāo)本和66 份支氣管肺泡灌洗液（BALF）樣本。在這些患者中，90例為重癥患者，320例為輕度和中度患者。

圖2. 患者狀況分布圖


不同呼吸道樣本中檢測新冠病原體

本期研究對(duì)發(fā)病后0-7天，8-14天和15天以上三個(gè)時(shí)間分別進(jìn)行了采樣。文章中的每個(gè)樣本均采用了上海伯杰醫(yī)療科技有限公司的新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒（熒光PCR法）進(jìn)行檢測。結(jié)果表明，發(fā)病0-7天樣本中，痰樣本的陽性率最高，其次是鼻咽拭子，然后是口咽拭子。在發(fā)病8-14天中，痰樣本也顯示出了最高的陽性率。而在15天以后，幾種樣本的陽性率基本持平。在0-7天和8-14天兩組中，重癥患者的支氣管肺泡灌洗液的陽性率為100%，但是輕度患者為陰性。15天后，重癥患者的支氣管肺泡灌洗液的陽性率依舊高達(dá)63.8%。并且隨著時(shí)間的增長，病毒載量和陽性率會(huì)逐漸降低。


上，下呼吸道的不同檢測結(jié)果

實(shí)驗(yàn)收集了21名新冠患者的上，下呼吸道樣本。在重癥患者中，RNA病毒能在大部分上呼吸道樣本中被檢測到。支氣管肺泡灌洗液樣本中的RNA病毒最早在第4天被發(fā)現(xiàn)，但重癥病例的Ct值較低。盡管病毒RNA在部分上呼吸道樣本中顯陰性，但在支氣管肺泡灌洗液樣本中會(huì)顯出陽性。相反，在輕度患者中，僅在上呼吸道檢測出了RNA病毒，而未在支氣管肺泡灌洗液樣本中檢測到。

圖3. RNA病原體的檢測狀況


結(jié)論：

1.多種樣本檢測結(jié)果互為補(bǔ)充，能夠有效防止漏檢：根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果，新冠不同疾病程度患者的痰樣本、鼻咽拭子、口咽拭子陽性率不同，痰液的檢出率相對(duì)較高。

2.重癥病例上呼吸道樣本檢出率低，需聯(lián)合其他輔助手段：經(jīng)過上，下呼吸道的樣本檢測，一些重癥病例的上呼吸道樣本中未檢測出病毒RNA但在痰液樣本中顯示為陽性。由此可見，盡管未在上呼吸道樣本中檢測到病毒RNA，但不應(yīng)將那些具有接觸史和臨床癥狀的可疑病例排除。在這種情況下，CT掃描可能為診斷COVID-19提供重要證據(jù)。


3.下呼吸道病毒脫落時(shí)間更長：研究發(fā)現(xiàn)，下呼吸道的病毒脫落時(shí)間可持續(xù)長達(dá)46天，這比先前發(fā)現(xiàn)的上呼吸道樣本的病毒脫落時(shí)間更長。在制定治療和抗擊病毒傳播的策略時(shí)，應(yīng)謹(jǐn)慎對(duì)待新冠病毒的異常病毒脫落情況。

圖4. RNA病毒的脫落持續(xù)時(shí)長


綜上所述，兩篇文章中均探討了針對(duì)不同樣本類型的新冠陽性檢出率。痰液的檢出率相對(duì)較高，但是除呼吸道樣本外糞便檢測也可以作為呼吸道樣本檢測很好補(bǔ)充。當(dāng)下疫情的重點(diǎn)之一，在于篩查出初期及無癥狀感染者，而多樣化的取樣送檢，可以有效地提高檢出率避免漏檢。


本文中所提及的學(xué)術(shù)研究所使用的檢測試劑，來自于上海伯杰醫(yī)療科技有限公司的新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒（熒光PCR法）。此番能夠在科研合作中出一份力，伯杰醫(yī)療深感榮幸。成立以來，伯杰醫(yī)療一直專注于傳染性病原體的診斷，秉承“勇于創(chuàng)新，質(zhì)量為先”的方針。助力檢驗(yàn)科研事業(yè)的發(fā)展，伯杰醫(yī)療責(zé)無旁貸！


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