核酸檢測(cè)技術(shù):《成人呼吸道感染病原診斷核酸檢測(cè)技術(shù)臨床應(yīng)用專(zhuān)家共識(shí)(2023)》解讀
為規(guī)范兒童呼吸道感染病原體核酸檢測(cè)的臨床應(yīng)用,相關(guān)領(lǐng)域?qū)<野l(fā)表了《兒童呼吸道感染病原體核酸檢測(cè)專(zhuān)家共識(shí)(2022)》,以指導(dǎo)兒童呼吸道感染病原體的核酸檢測(cè)。為進(jìn)一步解決呼吸道感染病原診斷核酸檢測(cè)技術(shù)在成人呼吸道感染中的規(guī)范應(yīng)用,中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)培訓(xùn)工程專(zhuān)家委員會(huì)組織我國(guó)多學(xué)科專(zhuān)家共同撰寫(xiě)了《成人呼吸道感染病原診斷核酸檢測(cè)技術(shù)臨床應(yīng)用專(zhuān)家共識(shí)(2023)》。
在核心專(zhuān)家意見(jiàn)部分,明確了PCR核酸檢測(cè)方法不同技術(shù)方案推薦應(yīng)用于不同的場(chǎng)景。并指實(shí)時(shí)熒光PCR包括單靶標(biāo)或多靶標(biāo)呼吸道病原體核酸檢測(cè),可作為核酸即時(shí)檢測(cè)法的參考方法,主要適用于門(mén)急診、住院患者和大規(guī)模人群篩查。針對(duì)免疫功能正常、存在住院風(fēng)險(xiǎn)的氣管支氣管炎成人患者,建議采用多靶標(biāo)病原體核酸檢測(cè)技術(shù)明確病原,以縮短抗生素使用時(shí)間和患者住院時(shí)間。對(duì)重癥社區(qū)獲得性肺炎患者同時(shí)進(jìn)行常規(guī)病原學(xué)檢查和核酸檢測(cè),以提高病原體檢出率。
推薦意見(jiàn)1:
實(shí)時(shí)熒光PCR包括單靶標(biāo)或多靶標(biāo)呼吸道病原體核酸檢測(cè),可作為核酸即時(shí)檢測(cè)法的參考方法,主要適用于門(mén)急診、住院患者和大規(guī)模人群篩查。
推薦意見(jiàn)2:
免疫功能正常、存在住院風(fēng)險(xiǎn)的氣管支氣管炎成人患者。針對(duì)此類(lèi)人群,建議采用多靶標(biāo)病原體核酸檢測(cè)技術(shù)明確病原,以縮短抗生素使用時(shí)間和患者住院時(shí)間。
推薦意見(jiàn)3:
建議對(duì)重癥社區(qū)獲得性肺炎患者同時(shí)進(jìn)行常規(guī)病原學(xué)檢查和核酸檢測(cè),以提高病原體檢出率。
推薦意見(jiàn)4:
醫(yī)院獲得性肺炎和呼吸機(jī)相關(guān)肺炎患者,病原學(xué)診斷應(yīng)以傳統(tǒng)培養(yǎng)方法為主,必要時(shí)聯(lián)合采用多靶標(biāo)病原體核酸檢測(cè),無(wú)需常規(guī)行mNGS,僅在患者存在免疫缺陷、3d內(nèi)未通過(guò)傳統(tǒng)微生物檢驗(yàn)明確病原體且經(jīng)驗(yàn)性抗感染治療無(wú)效時(shí),考慮行以DNA測(cè)序?yàn)橹鞯膍NGS。
二、呼吸道病原體核酸檢測(cè)方法
實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)技術(shù)
實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)是一種可對(duì)核酸進(jìn)行定量的試驗(yàn)方法,其原理主要是通過(guò)實(shí)時(shí)采集熒光信號(hào)對(duì)核酸擴(kuò)增進(jìn)行監(jiān)測(cè)。其特點(diǎn)是靈敏度和特異度好,但特異性引物探針的成本和對(duì)儀器的要求較高。主要適用于門(mén)急診、住院患者和大人群篩查,基于分子檢驗(yàn)平臺(tái)進(jìn)行病原體(包括病毒、細(xì)菌、真菌、非典型病原體)的核酸檢測(cè),檢測(cè)標(biāo)本類(lèi)型以鼻咽拭子、痰和支氣管肺泡灌洗液(BALF)為主。
需根據(jù)疾病流行情況、患者病情嚴(yán)重程度、癥狀持續(xù)時(shí)間、合并癥情況、免疫抑制狀態(tài)評(píng)估結(jié)果、其他輔助檢查結(jié)果的可參考性以及對(duì)預(yù)后的初步評(píng)判,決定是否對(duì)疑似急性上呼吸道感染的上述患者進(jìn)行檢測(cè)。
新型冠狀病毒肺炎或流感大流行期間,快速分子檢測(cè)有助于預(yù)檢分診、縮短就診時(shí)間、減少傳染病傳播風(fēng)險(xiǎn);又如,當(dāng)患者免疫功能?chē)?yán)重受損,同時(shí)疑似流感樣癥狀時(shí),或者呼吸道病毒檢測(cè)可能會(huì)影響醫(yī)生抗病毒藥物或停用抗生素的決定時(shí),需要對(duì)呼吸道病毒進(jìn)行檢測(cè)。
在流行風(fēng)險(xiǎn)高的季節(jié),高危人群(老年人、兒童、孕產(chǎn)婦、合并基礎(chǔ)疾病患者)進(jìn)行流感病毒檢測(cè)可能比經(jīng)驗(yàn)性抗流感治療更經(jīng)濟(jì)。此外,快速的結(jié)果反饋(如2h內(nèi)即出結(jié)果的快速分子檢測(cè))能夠縮短患者門(mén)急診就診時(shí)間,降低流感傳播風(fēng)險(xiǎn),有利于傳染病控制。
在流感病毒、新型冠狀病毒等大流行期間,門(mén)急診針對(duì)上述兩種病毒的抗原檢測(cè)或分子診斷技術(shù)有助于快速分診并指導(dǎo)隔離防控,避免院內(nèi)傳播,但前者敏感性低于后者。對(duì)于免疫功能正常且存在住院風(fēng)險(xiǎn)的成人患者而言,盡快采用多重PCR技術(shù)明確病原,可能會(huì)縮短抗生素使用時(shí)間和住院時(shí)間,但兒童毛細(xì)支氣管炎患者并不推薦常規(guī)病毒檢測(cè)。
若懷疑為支原體、衣原體、軍團(tuán)菌、病毒等感染時(shí),可采用血清特異性抗原、抗體檢測(cè)聯(lián)合核酸檢測(cè)和分離培養(yǎng);實(shí)時(shí)熒光PCR、等溫?cái)U(kuò)增、數(shù)字PCR、高通量測(cè)序技術(shù)可同時(shí)檢測(cè)多種病原體,提供病原體分型、毒力基因和耐藥基因等深入分析。如果臨床傾向于RNA病毒感染,建議選擇RNA高通量測(cè)序。危重癥患者同時(shí)開(kāi)展常規(guī)病原學(xué)檢查輔以病原體核酸檢測(cè),兩者可相互補(bǔ)充,有利于快速準(zhǔn)確確定致病原,更好地服務(wù)于臨床。
對(duì)于有流行病學(xué)史、流感樣癥狀或病情嚴(yán)重需要住院治療的AECOPD患者,推薦盡早進(jìn)行流感病毒、新型冠狀病毒等呼吸道病毒的抗原和/或核酸檢測(cè),核酸檢測(cè)的敏感性高于抗原檢測(cè)。
免疫功能受損患者,發(fā)生下呼吸道感染時(shí)病原學(xué)構(gòu)成更加復(fù)雜,條件致病菌、少見(jiàn)病原體、混合感染發(fā)生的比例更高,此時(shí)患者病情更重、進(jìn)展更迅速??煽紤]多種方法并行送檢,臨床常需積極開(kāi)展涵蓋目標(biāo)病原體的多靶標(biāo)核酸檢測(cè)或 mNGS以盡早診斷致病病原體。
「肺」你不可,靈動(dòng)「甲乙」
呼吸道感染解決方案
參考文獻(xiàn):
徐英春,瞿介明,中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)培訓(xùn)工程專(zhuān)家委員會(huì)等.成人呼吸道感染病原診斷核酸檢測(cè)技術(shù)臨床應(yīng)用專(zhuān)家共識(shí)(2023)[J/OL].協(xié)和醫(yī)學(xué)雜志:1-23.
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